Primeiramente vamos conhecer as funções de cada botão:

Esses são os botões para se mexer no minimap (+) Zoom In (-) Zoom Out (/\) Sobe um andar (\/) Desce um andar;

Pokebag. Clique com o botão direito para abri-la;

Pokedex, use-a para ganhar experiência obtendo informaçõµes dos pokemons. Clique com o botão direito e depois em um pokemon perto de você com o botão esquerdo, se você clicar em cima do seu personagem você poderá ver todos os pokemons que você ja deu 'dex';

Rope. Clique com o botão direito e depois com o esquerdo no buraco a ser subido;

Order, esse é o botão que serve para passar os comandos para seu pokemon. Clique no 'order' com o direito e depois com o esquerdo em um ponto da tela para que seu pokemon ande até la. Para pokemons que possuem habilidades especias: Para se abrir um buraco (Dig), cortar um arbustro (Cut) ou quebrar uma pedra (Rock Smash), clique no 'order' e depois no objeto. Para pokemons que possuem a habilidade light clique em cima deles. Para pokemons que possuem a habilidade Ride ou Fly, clique com o 'order' em cima de você e para pokemons que possuem a habilidade Surf clique com o 'order' na borda da água;

Badges, esse é o seu case de insignia, clique com o botão direito para abri-lo as coloridas são as suas insignias adquiridas, cada uma correspondende ao seu ginásio;

Coins Case, aqui são armazenadas as moedas utilizadas no cassino de Celadon. De 'Look' para ver a quantidade que você possui;

Fishing Rod, essa é a sua vara de pesca. Clique com o botão direito nela e depois na água para pescar pokemons, quanto maior seu skill maior a chance de pescar e melhor os pokemons que virão.
Temos também o botão Stop que serve para parar qualquer ação que esteja sendo feita;
O botão Quests que abre uma nova janela mostrando todas as quests em progresso e as concluidas.

O botão Options que permite a você mudar as configurações do seu cliente.

O botão Help que mostra as funções como as citadas acima só que em inglês.

E o Último que é o Leave que serve para você deslogar seu personagem assim como os atalhos Ctrl+L e Ctrl+Q.

Agora vamos as informações Básicas:

Abra a pokebag e você vera sua primeira pokebola e mais 10 unique pokeballs. Segure ela com o botão esquerdo e arraste-a para o local marcado. Se você fizer certo ficara como na outra imagem.

Para atacar você utiliza os comandos m1, m2, m3...
Cada Pokemon possui seu próprio ataque, você pode ver os ataques dele utilizando a pokedéx
Uma maneira mais fácil é colocando os comandos na 'Hotkey' (Ctrl+K) coloque os na ordem F1 = m1, F2 = m2, F3 = m3...

Para recuperar a vida do seu pokemon e a do seu personagem basta ir a um Centro Pokemon e dizer Hi a enfermeira Joy

Para capturar pokemons você primeiro precisa derrota-lo, depois você clica com o botão direito em uma empty pokeball e clica com o esquerdo em cima do pokemon a ser capturado

Para conseguir dinheiro derrote os pokemons e não esqueça de abrir o loot para pegar os itens que dropam para poder vender no Npc Mark e no Hugh.

Toda cidade possui uma loja em que o vendedor é o Mark, para comprar ou vender começe com 'Hi', 'Offer' para ver o que ele tem para vender e comprar. 'Buy' para comprar ex.: 'Buy 10 pokeball' e 'Sell' para vender ex.: 'Sell 100 straw' um erro comum é que muitos copiam e colam o nome dos itens e não conseguem vender. Pois eles estão no plural, quase sempre a forma certa é tirando o 's' do final ou intão separe 1 item e de look para ver o nome dele.

Para pescar basta sequir os procedimentos do primeiro tutorial, vá perto de algum rio, lago ou mar e clique com o botão direito na Fishing Rod e depois com o esquerdo na superfÃ*cie da água, quando pescar algo eles virão atacar você e apareceram sempre a sua volta.

Normalmente o aconselhavel no começo é você ir pescando os Magikarps até adquirir um pouco de experiência no jogo, depois você pode ir caçar alguns bellsprouts, pidgeys, zubat e alguns pokemons de água, com exessão do magikarp. Os meus primeiros foram o caterpie, o bellsprout e krabby.

Aqui segue uma lista de outros comandos utilizados no jogo e a sua explicação:
!cd - serve para checar o cold down do seu pokemon ou seja o tempo que demora para repetir o ataque;
!love - serve para 'acariciar' seu pokemon ou seja deixa-lo feliz;
!houseinfo - mostra as informaçõµes da sua casa se você possuir uma;
!sellhouse player - vende sua casa, ira abrir uma janela de trade normal em que o player ira colocar a quantia a ser trocada ou o item;
Aqui segue uma lista de emoticons:
!:) !:D !:S !:@ !pikachu !lol !yes !no !? !! !idea

As pokebolas existentes são:
Pokeball - chance de captura de 1x - $8
Greatball - chance de capturar de 2x - $28
Superball - chance de capturar de 3x - $65
Ultraball - chance de capturar de 4x - $130

No Pokemon Online os pokemons são divididos por elementos: Água, Folha, Terra, Veneno, Pedra, Normal/Voador, Lutador, Gelo, Elétrico, Psíquico e Fantasma.
Para evoluir seu pokemon você precisa de uma pedra evolutiva do elemento do seu pokemon, mesmo no anime ele não precisar de pedra para evoluir.
Ex.: para evoluir um Bulbasaur você precisa de uma Leaf Stone, para evoluir um ratata você precisa de uma Heart Stone...
Para adquirir essas pedras evolutivas você precisa derrotar os pokemons ja evoluidos até dropar uma exemplo para conseguir uma Leaf Stone eu tenho que matar qualquer tipo de pokemon de Folha desde que ele seja uma evoluçõeo ex.: Ivysaur, Venussaur, Gloom, Wepinbell, Victribell...

Quest são missões que você realiza dentro do jogo para obter itens e experiência. Você encontra varias delas dentro do jogo ao menos uma em cada cidade você consegue achar. A que eu indico é a do Guru da Pesca localizado ao lado do CP (Centro Pokemon) de Cerulean ele vai pedir para ver suas habilidades e dependendo do seu nivel de fishing ele vai lhe dar recompenças.
Sempre que for falar com um npc a respeito de quests diga a palavra Help

Sim, nunca deixe seu pokemon triste pois quanto mais triste ele estiver mais fraco será o ataque. Para recuperar a felicidade do seu pokemon use o comando !love para 'acaricia-lo' e vença batalhas.